L'agenzia regionale Agris Sardegna è l'Autorità Pubblica incaricata di espletare le funzioni di controllo per le produzioni Dop e Igp regionali, per le quali i soggetti richiedenti il marchio di origine non scelgano un organismo di controllo privato.
Pecorino Sardo Dop A partire dal 28 dicembre 2011, le funzioni di controllo per la Dop Pecorino Sardo sono assegnate all'Istituto Nord Est Qualità (INEQ).
Pecorino Romano Dop A partire dal 28 dicembre 2011, le funzioni di controllo per la Dop Pecorino Romano sono assegnate all'Istituto Nord Est Qualità (INEQ).